《爱莲说》的主旨句是 "莲，花之君子者也"，这句话位于文章结尾，是作者对莲花品格的高度概括和自我期许。

具体分析：

中心句与主旨句的区别

- 中心句：

通常指文章中概括主要内容的句子，如"予独爱莲之出淤泥而不染，濯清涟而不妖"。 - 主旨句：更侧重表达文章的核心思想或作者的价值观，如"莲，花之君子者也"。

"莲，花之君子者也"的深层含义

- 通过将莲花比作"君子"，周敦颐不仅赞美了莲花"出淤泥而不染，濯清涟而不妖"的品格，还借此表达了自己洁身自好、不与世俗同流合污的理想人格。

- 该句与文章开头的"水陆草木之花，可爱者甚蕃"形成对比，突出了莲花在众花中的独特价值。

作者的用意

- 周敦颐通过莲花这一意象，隐喻自己身处污浊环境却保持清正的处境，表达了对当时社会风气的批判。

- "同予者何人"的反问，进一步强调了具有莲花品格者的稀缺性，流露出作者的孤独与坚守。

综上， "莲，花之君子者也"不仅是《爱莲说》的精髓，也是作者人格魅力的集中体现。