《细菌世界历险记》的主要内容可分为以下核心部分，结合不同版本和解读角度进行梳理：

一、故事背景与主人公

核心设定：主人公“菌儿”是一种具有拟人化特征的细菌，通过一种能将人类缩小至亿分之一毫米的神奇液体，意外进入细菌世界。

身份与使命：菌儿向细菌国王表明人类身份，因智慧和能力被聘为军师，最终成功在细菌王国安家。

二、主要情节发展

误入细菌世界

菌儿因液体作用进入细菌王国，经历细菌士兵的迎接，通过智慧与国王沟通，获得信任并成为军师。

保卫家园之战

细菌王国面临黑细菌（病毒）的威胁，菌儿巧妙安排白细菌（有益细菌）展开战争，最终成功消灭黑细菌并研制出解药，拯救了细菌王国。

三、科学知识普及

细菌特性：

通过菌儿的视角，读者了解细菌的生存环境、代谢方式及与人类的互动关系。

卫生重要性：书中强调科学防病的重要性，如避免细菌感染、保持环境卫生等。

益处与危害：客观呈现有益细菌（如消化、免疫）和有害细菌（如致病）的双面性。

四、写作特色

拟人化手法：以“菌儿”的视角和诗一般的语言，将复杂的科学知识转化为通俗易懂的故事。

文学性与科学性结合：既包含科学原理，又融入文学创作，适合青少年阅读。

五、附加信息

作者背景：作者高士其通过自身经历（甲型脑炎病毒感染）引发对细菌世界的思考，以科普与文学结合的方式创作此书。

以上内容综合了多个版本的信息，既保留了核心冒险情节，又突出了科学教育意义。