上官云顿追杀小郭的情节出现在《武林外传》 第六集。以下是相关剧情的详细说明：

起因

杨蕙兰因比武招亲失败后，误将小郭认作男子并欲嫁之。她与白展堂合谋制造假象，但被小郭识破。

发展

杨蕙兰发现真相后，愤而离开同福客栈，自称为“郭芙蓉”并招揽山寨杀手追杀小郭。她先后派来“美丽不打折”（被白展堂点穴）、“金银二老”（被毒蝎咬死），最终派上官云顿。

高潮

上官云顿以慈祥老爷爷形象出现，实则心狠手辣。他在第六集中与李大嘴等角色互动，并最终参与了对小郭的追杀。

综上，该情节明确发生在第六集，与搜索结果中的描述一致。