收到短信告知不按规定停放车辆但仍被开单，可能有以下几种原因：

停车位规定时间：

有些停车位有特定的停放时间限制，例如临时停车位可能只允许停10分钟，或者规定时间的停车位是半小时到1小时。如果车辆停放时间超过了这些限制，即使车辆停在了停车位内，也会被开罚单。

压线停车：

有些车主可能因为急事或赶时间，只将车大部分停进了停车位里，但有一小部分压线。这种情况下，即使车辆停在了停车位内，也会因为压线而被开罚单。

未按规定停车方向：

在路边停车时，要求所有车辆停车的方向必须一致。如果车辆的停车方向与其他车辆不一致，即使车辆停在了停车位内，也会被视为逆向停车，从而被开罚单。

占用临时车位超时：

在一些学校、医院、车站附近会设有临时停车位，这些车位通常有警示牌，明确标注可以临时停车的时间。如果车辆在这些临时车位上停车超时，也会被开罚单。

隐形规定：

有些停车场或路边停车位可能有“隐形”的处罚规定，例如车辆停放位置与行车道方向逆向，或者车辆没有完全停放在车位内（如右轮在车位内，左轮在线外），这些情况都可能导致被开罚单。

辅警开具的提醒单：

不按规定停放提醒单一般情况下不需要处理，它是由辅警开具的，用来提醒车主已经将车停在了不能停放的地方。这种单子主要是为了提醒车主改正，并不一定会导致实际处罚。

其他违规行为：

除了上述原因外，还可能存在其他违规行为，例如车辆堵塞消防通道、影响交通通行等，这些行为也会导致被开罚单。

综上所述，即使车辆停在了停车位内，也有可能因为多种原因被开罚单。建议车主在停车时务必注意遵守相关停车规定，避免不必要的罚款。